Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSCO60682 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MSCO60682 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSCO60682 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSCO60682 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSCO60682 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSCO60682 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSCO60682 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSCO60682 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSCO60682 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSCO60682 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSCO60682 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSCO60682 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSCO60682 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSCO60682 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSCO60682 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSCO60682 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSCO60682 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSCO60682 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSCO60682 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSCO60682 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSCO60682 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSCO60682 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSCO60682 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSCO60682 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSCO60682 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSCO60682 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSCO60682 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSCO60682 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSCO60682 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSCO60682 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSCO60682 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSCO60682 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSCO60682 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSCO60682 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSCO60682 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSCO60682 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSCO60682 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSCO60682 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSCO60682 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSCO60682 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSCO60682 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSCO60682 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSCO60682 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms