Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM3APO60318 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM3APO60318 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms