Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PLIN1O60240 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PLIN1O60240 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms