Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCXO43602 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DCXO43602 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCXO43602 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCXO43602 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCXO43602 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCXO43602 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCXO43602 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCXO43602 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCXO43602 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DCXO43602 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCXO43602 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCXO43602 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCXO43602 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DCXO43602 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCXO43602 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCXO43602 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCXO43602 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCXO43602 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCXO43602 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCXO43602 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCXO43602 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCXO43602 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCXO43602 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms