Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF12O43508 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF12O43508 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFSF12O43508 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFSF12O43508 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFSF12O43508 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFSF12O43508 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFSF12O43508 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFSF12O43508 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.7 ms