Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLF4O43474 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF4O43474 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF4O43474 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF4O43474 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF4O43474 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF4O43474 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLF4O43474 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF4O43474 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF4O43474 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF4O43474 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF4O43474 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF4O43474 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLF4O43474 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF4O43474 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF4O43474 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF4O43474 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF4O43474 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF4O43474 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF4O43474 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLF4O43474 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF4O43474 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF4O43474 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF4O43474 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF4O43474 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF4O43474 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLF4O43474 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLF4O43474 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF4O43474 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF4O43474 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF4O43474 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF4O43474 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF4O43474 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF4O43474 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF4O43474 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF4O43474 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLF4O43474 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLF4O43474 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLF4O43474 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF4O43474 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF4O43474 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF4O43474 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF4O43474 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF4O43474 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF4O43474 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF4O43474 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF4O43474 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF4O43474 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF4O43474 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF4O43474 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF4O43474 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF4O43474 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF4O43474 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF4O43474 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF4O43474 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF4O43474 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF4O43474 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF4O43474 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF4O43474 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF4O43474 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms