Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LRRTM2O43300 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
LRRTM2O43300 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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