Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRODHO43272 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRODHO43272 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRODHO43272 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRODHO43272 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRODHO43272 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRODHO43272 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRODHO43272 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRODHO43272 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRODHO43272 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRODHO43272 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRODHO43272 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRODHO43272 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms