Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD3O43242 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD3O43242 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMD3O43242 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms