Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DYNC1LI2O43237 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DYNC1LI2O43237 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms