Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLGNO14967 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLGNO14967 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLGNO14967 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLGNO14967 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLGNO14967 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLGNO14967 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLGNO14967 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLGNO14967 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLGNO14967 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLGNO14967 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLGNO14967 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLGNO14967 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLGNO14967 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLGNO14967 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLGNO14967 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLGNO14967 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLGNO14967 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLGNO14967 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLGNO14967 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLGNO14967 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLGNO14967 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLGNO14967 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLGNO14967 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLGNO14967 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLGNO14967 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLGNO14967 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLGNO14967 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLGNO14967 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLGNO14967 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLGNO14967 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLGNO14967 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLGNO14967 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLGNO14967 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLGNO14967 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLGNO14967 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLGNO14967 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLGNO14967 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLGNO14967 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLGNO14967 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLGNO14967 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLGNO14967 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLGNO14967 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLGNO14967 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLGNO14967 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLGNO14967 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLGNO14967 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms