Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKBKBO14920 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms