Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCANO14594 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCANO14594 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCANO14594 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCANO14594 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCANO14594 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCANO14594 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCANO14594 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCANO14594 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCANO14594 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCANO14594 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCANO14594 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCANO14594 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCANO14594 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCANO14594 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCANO14594 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCANO14594 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCANO14594 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NCANO14594 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCANO14594 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCANO14594 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCANO14594 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCANO14594 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCANO14594 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCANO14594 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCANO14594 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCANO14594 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCANO14594 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCANO14594 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCANO14594 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCANO14594 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCANO14594 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCANO14594 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCANO14594 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCANO14594 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCANO14594 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCANO14594 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCANO14594 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCANO14594 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCANO14594 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCANO14594 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NCANO14594 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCANO14594 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCANO14594 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCANO14594 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NCANO14594 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NCANO14594 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCANO14594 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCANO14594 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCANO14594 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NCANO14594 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCANO14594 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCANO14594 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NCANO14594 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCANO14594 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCANO14594 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCANO14594 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCANO14594 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NCANO14594 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCANO14594 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCANO14594 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCANO14594 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms