Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KPNA3O00505 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KPNA3O00505 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms