Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA2O00451 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GFRA2O00451 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GFRA2O00451 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms