Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE2AO00408 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE2AO00408 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms