Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TULP2O00295 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TULP2O00295 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP2O00295 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP2O00295 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP2O00295 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP2O00295 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP2O00295 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP2O00295 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TULP2O00295 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TULP2O00295 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TULP2O00295 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TULP2O00295 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TULP2O00295 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TULP2O00295 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TULP2O00295 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TULP2O00295 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TULP2O00295 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TULP2O00295 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TULP2O00295 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP2O00295 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP2O00295 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP2O00295 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP2O00295 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP2O00295 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP2O00295 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP2O00295 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP2O00295 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP2O00295 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms