Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TLR4O00206 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TLR4O00206 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR4O00206 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR4O00206 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR4O00206 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR4O00206 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR4O00206 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR4O00206 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TLR4O00206 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR4O00206 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR4O00206 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR4O00206 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR4O00206 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR4O00206 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR4O00206 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR4O00206 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR4O00206 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TLR4O00206 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TLR4O00206 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TLR4O00206 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TLR4O00206 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TLR4O00206 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TLR4O00206 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR4O00206 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR4O00206 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR4O00206 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR4O00206 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TLR4O00206 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms