Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QKU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QKU1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
J3QKU1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
J3QKU1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
J3QKU1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
J3QKU1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
J3QKU1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
J3QKU1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
J3QKU1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms