Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
J3KR12 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
J3KR12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
J3KR12 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
J3KR12 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KR12 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KR12 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KR12 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KR12 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KR12 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
J3KR12 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
J3KR12 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
J3KR12 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
J3KR12 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
J3KR12 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms