Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BM21 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BM21 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BM21 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BM21 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BM21 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BM21 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BM21 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BM21 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BM21 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BM21 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BM21 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BM21 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BM21 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BM21 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BM21 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BM21 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BM21 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3BM21 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BM21 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BM21 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BM21 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3BM21 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3BM21 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BM21 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BM21 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BM21 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BM21 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BM21 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3BM21 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3BM21 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3BM21 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3BM21 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms