Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E9PMD0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E9PMD0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
E9PMD0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PMD0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PMD0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PMD0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PMD0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PMD0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PMD0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
E9PMD0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PMD0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PMD0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PMD0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PMD0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PMD0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PMD0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E9PMD0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PMD0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PMD0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PMD0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PMD0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
E9PMD0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PMD0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PMD0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PMD0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
E9PMD0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PMD0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PMD0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PMD0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PMD0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PMD0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
E9PMD0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PMD0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PMD0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PMD0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E9PMD0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E9PMD0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PMD0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PMD0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PMD0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PMD0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PMD0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E9PMD0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PMD0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PMD0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PMD0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PMD0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PMD0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PMD0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PMD0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E9PMD0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms