Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
E9PCH4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
E9PCH4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
E9PCH4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
E9PCH4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
E9PCH4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
E9PCH4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
E9PCH4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
E9PCH4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
E9PCH4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
E9PCH4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
E9PCH4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
E9PCH4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
E9PCH4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
E9PCH4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
E9PCH4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
E9PCH4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
E9PCH4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
E9PCH4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
E9PCH4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
E9PCH4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
E9PCH4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
E9PCH4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
E9PCH4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
E9PCH4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
E9PCH4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
E9PCH4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
E9PCH4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
E9PCH4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
E9PCH4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
E9PCH4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
E9PCH4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
E9PCH4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
E9PCH4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
E9PCH4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
E9PCH4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
E9PCH4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
E9PCH4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
E9PCH4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
E9PCH4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
E9PCH4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
E9PCH4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
E9PCH4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
E9PCH4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
E9PCH4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
E9PCH4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
E9PCH4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
E9PCH4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
E9PCH4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
E9PCH4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
E9PCH4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
E9PCH4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
E9PCH4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
E9PCH4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
E9PCH4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
E9PCH4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
E9PCH4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
E9PCH4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms