Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGB1P1B2RPK0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGB1P1B2RPK0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGB1P1B2RPK0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms