Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CENPBD1B2RD01 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CENPBD1B2RD01 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms