Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT8L1PA6NM43 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCT8L1PA6NM43 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms