Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC85CA6NKD9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC85CA6NKD9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85CA6NKD9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms