Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCNX2A6NKB5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCNX2A6NKB5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX2A6NKB5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms