Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF233A6NK53 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF233A6NK53 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF233A6NK53 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms