Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HELTA6NFD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HELTA6NFD8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms