Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNDIG1LA6NDD5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNDIG1LA6NDD5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNDIG1LA6NDD5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms