Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms