Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VWA8A3KMH1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VWA8A3KMH1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VWA8A3KMH1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms