Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PIPSLA2A3N6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PIPSLA2A3N6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 336.5 ms