Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091941.1-201ENST00000623003 576 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC002451.1-202ENST00000432265 771 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021683.4-201ENST00000623348 1099 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms