Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9Y3F1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q9Y3F1 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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