Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYNGAP1Q96PV0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms