Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CGNL1Q0VF96 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CGNL1Q0VF96 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms