Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ZNF551-202ENST00000596085 469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMARCA4P51532 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms