Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDC27P30260 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC27P30260 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC27P30260 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC27P30260 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms