Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HOXD10P28358 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HOXD10P28358 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms