Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBTFP17480 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms