Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RRN3P1Q2M238 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms