Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDCD2Q16342 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDCD2Q16342 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms