Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PTPRJQ12913 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms