Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ELP4-202ENST00000379163 1700 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RPL23P62829 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms