Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RPS29P62273 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms