Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBTFP17480 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBTFP17480 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBTFP17480 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBTFP17480 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBTFP17480 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms