Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLIP2Q9UDT6 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms