Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP46P62068 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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USP46P62068 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP46P62068 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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